TJI sendiri, memiliki misi untuk meningkatkan kesadaran masyarakat akan pentingnya pencegahan penyakit jantung dan pembuluh darah, melaksanakan tata kelola organisasi berdasarkan prinsip Good Governance, dan membangun kemitraan dengan seluruh pemangku kepentingan.
Keberadaan Yayasan Jantung Indonesia ini tersebar diseluruh Provinsi di Indonesia dengan Cabang Utama dan Cabangnya.